为进一步提高进出口货物通关效率，促进对外贸易持续、协调、健康发展，2008年7月18日，国家质检总局发布了《关于实施进出口货物检验检疫直通放行制度的公告》，宣布自公告之日起，进出口企业可向所在地出入境检验检疫机构提出直通放行申请，各直属出入境检验检疫局依据《进出口货物检验检疫直通放行管理规定》，对符合直通放行条件的进出口货物实施出入境检验检疫直通放行。
据悉，直通放行制度实施后，把过去口岸、内地两道关口变为一道关口。对出口企业而言，只需经产地检验检疫机构施检合格，就可凭通关单在报关地海关直接办理通关手续，而不必再像以前那样在口岸二次申报，接受口岸检验检疫机构的二次查验。对进口企业而言，不再实施口岸检验检疫，货物直接运到目的地后，由目的地检验检疫机构实施检验检疫。也就是说，进出口货物实施直通放行以后，由于货物在口岸不再实施卸货查验，企业至少可以得到以下两个实惠：一是减少了相应压港、掏柜等费用的支出，较大幅度降低了口岸通关成本，二是货物滞港时间相应减少，通关效率得以大幅提高，出境货物装运船期以及进境货物到货时间变得更加可控。据初步估算，光是企业在口岸免去的吊箱、仓储等占用费，一个集装箱大约就可以节约600多元人民币，可为相关进出口企业节省费用约2亿元人民币，并且，实施直通放行模式的每批货物通关时间也可加快1到2天。
深圳检验检疫局透露，深圳地区目前有近150家企业符合条件，希望这些企业尽快向深圳检验检疫部门提出申请，深圳局将在8个工作日（不包括现场评审时间）内完成审核批准，不需要任何费用。