被深圳海关列为今年工作重中之重的海运通关改革于2004年7月23日在盐田港正式全面启动。作为深圳海关第二轮海运通关改革的试点，此次改革将在集中查验、风险管理、进出口预申报等方面迈出关键步伐，是近年海关改革的重大突破。
大鹏海关关长唐龙军先生在启动仪式上表示：“此次改革将以统一作业流程和执法尺度、实现一站式服务及无纸化电子信息传递等为目标，力争使海关成为盐田港大通关中最为便捷高效的一环，以支持和促进盐田港的进一步发展。”
所有使用盐田港的进出口企业、货主及船公司将从改革中获益。仅进口预申报不再强制要求舱单中文翻译一项，即为货物节省2-5天通关时间。而新推出的集中查验，也将缩短验柜滞留时间，避免因查验产生仓租或改船。
进口预申报方面，海关允许提前申报及取消书面舱单内部流转及核注，从而缩短报关时间1-2天。海关对信誉良好的企业之货物，船到前接单审核、征收税费，箱落地即放行；对于出口货物，入闸前接单审核，箱入闸即查验或放行，有利于提高船公司的空箱周转率及拖车运转效率。此外，对于更改船名、出口转关等方面海关也将出台港区一船式及卡口核放新举措，全部改革计划将在年底前推出，并逐步实施。
此次通关改革的各项措施不仅缩短了集装箱堆存期，提高了码头堆场利用率，而且通关时间缩短、效率提高，会为客户节省通关的成本开支，有助于客户的市场竞争。